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基因数据处理43之mango之503错误
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：88
HTTP ERROR : 503 Problem accessing /. Reason : Service Unavailable Powered by Jetty :// 更详细请见： https://github.com/bigdatagenomics/mango/issues/181[详细]
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基因数据处理37之bdg-formats编译成功
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：191
更多代码请见：https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 bdg-formats是在spark平台上用avro定义的基因处理的数据格式，包括read、sam、vcf、databaseannotion在云平台上的格式，主要用于Adam系统中 2.代码： 【2】下载 编译： mvn clean package -Dsk[详细]
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《hadoop进阶》PeopleRank从社交关系中挖掘价值用户
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：140
转载请注明出处： 转载自? Thinkgamer的CSDN博客： blog.csdn.net/gamer_gyt 代码下载地址：点击查看 1：PageRank 与 PeopleRank 2：需求分析：挖掘CSDN博客的价值用户 3：算法模型：PeopleRank算法 4：架构设计：从数据准备到PR算法的MR化 5：程序开发：had[详细]
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XTU 1247 Robb#39;s Problem
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：64
Robb’s Problem [ Submit Code ] [ Top 20 Runs ] Acceteped : 48 ? Submit : 335 Time Limit : 1000 MS ? Memory Limit : 65536 KB ? Description Robb’s Problem 题目描述 Robb想知道阶乘 n ! 第 m 位数码是什么？ 输入 第一行是一个整数 T , ( 1 ≤ T[详细]
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基因数据处理38之dbSnpId到omimId的映射表
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：80
1.下载： 首先收到【2】，来源是【2】 【1】中有描述： You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim of interest (hu[详细]
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基因数据处理39之mango安装记录
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：147
更多代码请见：https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 mango安装记录 mango主要是在adam上实现 可视化平台 A scalable genome browser 2.代码： git clone https: //github.com/bigdatagenomics/mango.git cd mangomvn clean package -DskipTests[详细]
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基因数据处理41之mango使用失败
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：167
hadoop@Master:~/xubo/tools/adam- 2.10 - 0.19 -git/bin$ mango-submit /xubo/mango/snap/datatest .fa .adam -read_files /xubo/mango/snap/datatest2 .sort .bam .adam -var_files /xubo/mango/snap/datatest2 .flt .vcf .adam -feat_file /xubo/mango/sn[详细]
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51NOD 1116 K进制下的大数(字符串取模 + 枚举)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：164
传送门 1116 K进制下的大数 基准时间限制：1 秒 空间限制：131072 KB 分值: 20 难度：3级算法题 收藏 关注 有一个字符串S，记录了一个大数，但不知这个大数是多少进制的，只知道这个数在K进制下是K - 1的倍数。现在由你来求出这个最小的进制K。 例如：给出的[详细]
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poj3181 Dollar Dayz (DP+大数)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：179
Dollar Dayz Crawling in process... Crawling failed Time Limit: 1000 MS???? Memory Limit: 65536 KB???? 64bit IO Format: %I64d %I64u Submit Status Practice POJ 3181 Appoint description: System Crawler (2016-05-27) Description Farmer John goe[详细]
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基因数据处理40之bedtools的安装和使用
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：54
1.下载： git clone https: //github.com/arq5x/bedtools.git 2.编译： make 3.配置： cp * /usr/local /bin/ 4.运行： bam变成bed hadoop @Master :~/xubo/data/snap $ bamToBed -i datatest.sorted.bam datatest.sorted.bed 查看： hadoop @Master :~/xubo[详细]
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基因数据处理42之mango问题_seqdict.avro不存在解决
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：164
参考【1】中问题解决 问题分析：这是新版本的问题：adam0.19.1目前在maven中心仓库没有 解决办法： package org.gcdss.test import java.io.File import java.nio.file.Files import org.apache.parquet.hadoop.metadata.CompressionCodecName import org.ap[详细]
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Twitter开源大数据实时分析系统Heron：Heron架构
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：149
Heron架构 Heron是Apache Storm的一个直接继承者。从架构角度来看，它与Storm截然不同，但是从API的角度看它是完全向后兼容的。 下面的章节指明了Heron和Storm的区别，描述了Heron背后的设计目标，并解释了其架构的主要组件。 代码库 Heron代码库的详细指南[详细]
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大数据分析界的“神兽”Apache Kylin初解
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：103
转自李栋，来自Kyligence公司，也是Apache Kylin Committer PMC member，在加入Kyligence之前曾就职于eBay、微软。 今天分享的主题是：聊聊“神兽”Apache Kylin的最新特性。本次分享将首先对Apache Kylin进行基本介绍；接下来介绍1.5.x最新版本在架构上的重[详细]
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kylin-BI工具-tableau9
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：63
Tableau 9 Tableau 9.x has been released a while,there are many users are asking about support this version with Apache Kylin. With updated Kylin ODBC Driver,now user could interactive with Kylin service through Tableau 9.x. Apache Kylin cu[详细]
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Presto随笔
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：54
解决了什么问题 快读的交互式查询 presto 和hive到底什么关系 http://www.mutouxiaogui.cn/blog/?p=395 和hive在一个层级，都是基于hdfs的。但是presto可以借助hive的元信息找到hdfs上的节点。 presto现在已经可以连接 MySQL postgre hive等了 presto为什么[详细]
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HDOJ/HDU 5686 Problem B(斐波拉契+大数~)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：131
Problem Description 度熊面前有一个全是由1构成的字符串，被称为全1序列。你可以合并任意相邻的两个1，从而形成一个新的序列。对于给定的一个全1序列，请计算根据以上方法，可以构成多少种不同的序列。 Input 这里包括多组测试数据，每组测试数据包含一个正[详细]
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如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：71
中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机，掘得富矿？中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称：数博会)上发表致辞时，为此描绘出四大清晰路径。 路径一：大数据[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：140
（点击 上方公众号 ，可快速关注） 英文：Anna Nicolauo 译者：伯乐在线 - 胡波 链接：http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长，大数据渗透到了各行各业，广泛应用于公司中，同时也使得传统的软件比如 Excel[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：118
需要注意的是如果使用avocado的命令行，fs和fq为hdfs路径，properties为本地路径： hadoop @Master :~/xubo/data/testTools/se $ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basi[详细]
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LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe（欧拉函数）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：55
题目链接： LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe 题意： 给出n个数，要求对每个数a[i]找一个数x[i]使得小于x[i]且与x[i]互素的数的个数不小于a[i],求出所有x[i]的最小和。 分析： 和最小则每个数对应的x[i]应最[详细]
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基因数据处理26之bcftools安装和使用
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：163
1.下载： https://github.com/samtools/bcftools 2.安装 make make install 3.结合samtools使用 对排序好的bam数据用samtools生成bcf文件： xubo @xubo :~/xubo/data/testTools/se $ samtools mpileup -ugf ../hs38DH.fa hs2.sort.bam hs2.bcf 由于生成的是[详细]
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saiku （branch 3.8-release）构建步骤
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：109
近日整理了saiku（branch 3.8-release）的构建步骤，分享出来以供大家参考 红色的为原有被注释的 绿色的为添加的 蓝色地方比较重要，为我修改的地方，与上方红色对照下 前提是需要下载 mondrian- 4.3.0.1-SPARK的包放到自己的nexus中 源码地址： ? ?? https:[详细]
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数据嗨客 | 第6期：不平衡数据处理
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：117
http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwMzIxMjIyMg==mid=2651005812idx=1sn=b9819f04cb2ee9af21f4011d34013824scene=0 写的挺好： 常用的分类算法一般假设不同类的比例是均衡的，现实生活中经常遇到不平衡的数据集，比如广告点击预测（点击转化率一般都很小）[详细]
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第四期数据分析课程~
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：108
第四期课程对比前三期课程我们做了如下的优化： 1. 增加一节新课：关于numpy在数据分析和机器学习中的应用 2. 讲解map与lambda函数 3. 优化机器学习课程内容，手把手教你推导数学公式 4. 修改第十节课程，增加实践操作环节 购买后请各位同学一定要在「阅读原[详细]
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为了驾驭大数据处理，中外互联网巨头做了同样的选择
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：196
数据，数据，我要大数据 在今天这个大数据的时代，数据已经成为了许多企业发展的命脉。 图片转自synergicpartners 有些企业需要数据来形成用户洞察，有的企业需要数据来优化业务流程；甚至对于部分企业来说，数据就是他们最珍贵的资产。 在这个卖煎饼都需要[详细]
